داستان بازی Overlord II سیزده سال بعد از نسخه اول آن اتفاق می افتد. در این بازی پسر Overlord قبلی شروع به جمع آوری Minion ها می کند تا دوباره به مقر فرماندهی پدرش یعنی Netherworld برود. در Overlord II امپراطوری روم تمام جهان را به دست گرفته است و هنگامی که پسر Overlord قصد جمع آوری سپاه دارد، امپراطوری روم برای از بین بردن این سپاه به شهر نوردبرگ حمله میکند و برای این کار از موجوداتی جادویی استفاده می کند. بعد از این که قسمتی از سپاه نابود می شود؛ قهرمان بازی در طی یک اتفاق به داخل آب می افتد و در آنجا یخ می زند اما Minion او را به Netherworld و نزد مشاور پدرش می برند. مشاور پدرش نیز او را به عنوان OverLord جدید می خواند و اینجاست که داستان اصلی بازی شروع می شود. شما باید راهی برای نیروهای تاریکی باز کنید تا آن ها بتوانند امپراطوری روم را از بین ببرند. البته به غیر از امپراطوری شما دشمنان دیگری هم دارید ولی کماکان خطرناک ترین و مهم ترین آن ها همین امپراطوری روم است.